Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

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Length 801 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM4Q9UKN5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM4Q9UKN5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRDM4Q9UKN5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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