Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSKSQ9UJT2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSKSQ9UJT2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSKSQ9UJT2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSKSQ9UJT2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms