Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA3Q9UI47 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms