Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA4Q9UI42 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms