Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK1NQ9UHG2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms