Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms