Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms