Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF1

MAGEC2, Melanoma-associated antigen C2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC2Q9UBF1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAGEC2Q9UBF1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MAGEC2Q9UBF1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAGEC2Q9UBF1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC2Q9UBF1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms