Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFIP11Q9UBB9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms