Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF9Q9P2J2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms