Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3BP4Q9P0V3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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SH3BP4Q9P0V3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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SH3BP4Q9P0V3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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