Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKD2L1Q9P0L9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms