Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDP1Q9P0J1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDP1Q9P0J1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms