Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms