Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.73
ARHGEF12Q9NZN5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms