Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ3

GTSE1, G2 and S phase-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSE1Q9NYZ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTSE1Q9NYZ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTSE1Q9NYZ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms