Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MIS18AQ9NYP9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MIS18AQ9NYP9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms