Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK4Q9NYG8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms