Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VNN3Q9NY84 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms