Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDND1Q9NY35 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDND1Q9NY35 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms