Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms