Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms