Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms