Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
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