Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLN6Q9NWW5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLN6Q9NWW5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms