Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A7Q9NVC3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A7Q9NVC3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A7Q9NVC3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A7Q9NVC3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A7Q9NVC3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A7Q9NVC3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A7Q9NVC3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A7Q9NVC3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A7Q9NVC3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms