Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM140Q9NV12 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms