Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCM2LQ9NUG4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCM2LQ9NUG4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCM2LQ9NUG4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCM2LQ9NUG4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCM2LQ9NUG4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCM2LQ9NUG4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCM2LQ9NUG4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCM2LQ9NUG4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCM2LQ9NUG4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCM2LQ9NUG4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCM2LQ9NUG4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCM2LQ9NUG4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCM2LQ9NUG4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms