Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms