Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM7SF3Q9NS93 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM7SF3Q9NS93 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms