Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS45Q9NRW7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms