Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INCENPQ9NQS7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms