Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
XPNPEP3Q9NQH7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms