Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZCCHC17Q9NP64 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms