Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms