Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOPCQ9HD26 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOPCQ9HD26 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms