Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1LQ9HCJ6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms