Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIN28AQ9H9Z2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms