Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms