Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M3

FBXO44, F-box only protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO44Q9H4M3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO44Q9H4M3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO44Q9H4M3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms