Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EHD4Q9H223 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms