Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG9Q9H0W8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms