Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTMR12Q9C0I1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms