Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTPBP4Q9BZE4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms