Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCO2Q9BYV7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCO2Q9BYV7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms