Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 766.6 ms