Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms