Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms