Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.7 ms