Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms